virus-monitor

# virus-monitor Kombiniert mehrere österreichische Datenquellen für Virus-Monitoring: ## Datenquellen 1. **Nationales Abwassermonitoring** (abwassermonitoring.at) - SARS-CoV-2 Genkopien pro Einwohner/Tag - Bundesländer-Daten inkl. Wien 2. **MedUni Wien Sentinel System** (viro.meduniwien.ac.at) - Positivitätsraten für respiratorische Viren - DINÖ (Diagnostisches Influenza Netzwerk Österreich) - Wöchentliche Berichte 3. **AGES Abwasser Dashboard** (abwasser.ages.at) - SARS-CoV-2, Influenza, RSV - Österreichweit ## Usage ```bash # Alle Daten als JSON virus-monitor # Nur bestimmte Quelle virus-monitor --source abwasser virus-monitor --source sentinel virus-monitor --source ages ``` ## Output ```json { "timestamp": "2026-01-09T00:37:00Z", "status": "erhöht", "sources": { "abwasser": { ... }, "sentinel": { ... }, "ages": { ... } }, "summary": { "wien": { "sars_cov_2": "...", "influenza": "...", "rsv": "..." } } } ``` ## Status-Levels - `niedrig` - Normale saisonale Aktivität - `moderat` - Erhöhte Aktivität, Aufmerksamkeit empfohlen - `erhöht` - Deutlich erhöhte Aktivität - `hoch` - Starke Virus-Zirkulation ## Dependencies - `curl` - HTTP requests - `jq` - JSON processing - Standard Unix tools (awk, grep, sed) ## Notes - Abwasserdaten haben ~1-2 Wochen Verzögerung - Sentinel-Daten werden wöchentlich aktualisiert (Freitags) - AGES Dashboard ist eine Shiny-App (dynamisch)